ศูนย์ป้องกันวิกฤติน้ำ ได้รับรางวัล DWR Innovation Award ประจำปี พ.ศ. 2564 ประเภททีม ระดับดีเด่น ด้วยผลงาน "การวิเคราะห์สมดุลน้ำระดับตำบลในพื้นที่นอกเขตชลประทานของประเทศไทย" โดยทีมเมขลา ซึ่งนำทีมโดย ดร.สุประภาพ พัฒน์สิงหเสนีย์ ผู้อำนวยการศูนย์เมขลา นายจิระวัฒน์ ประชีพฉาย วิศวกรโยธาชำนาญการ และนายธนัช สระประเทศ นักวิเคราะห์นโยบายและแผนปฏิบัติการ